git-svn: use platform specific auth providers
[gitweb.git] / builtin / apply.c
index b719f41482ee3be39d91a30f93eeabaf9d96be55..799bb5e906c1e6de6c95cad4b9f4ee8fedf258f0 100644 (file)
@@ -14,6 +14,7 @@
 #include "builtin.h"
 #include "string-list.h"
 #include "dir.h"
+#include "diff.h"
 #include "parse-options.h"
 
 /*
@@ -43,6 +44,7 @@ static int apply = 1;
 static int apply_in_reverse;
 static int apply_with_reject;
 static int apply_verbosely;
+static int allow_overlap;
 static int no_add;
 static const char *fake_ancestor;
 static int line_termination = '\n';
@@ -150,9 +152,14 @@ struct fragment {
        unsigned long leading, trailing;
        unsigned long oldpos, oldlines;
        unsigned long newpos, newlines;
+       /*
+        * 'patch' is usually borrowed from buf in apply_patch(),
+        * but some codepaths store an allocated buffer.
+        */
        const char *patch;
+       unsigned free_patch:1,
+               rejected:1;
        int size;
-       int rejected;
        int linenr;
        struct fragment *next;
 };
@@ -194,6 +201,36 @@ struct patch {
        struct patch *next;
 };
 
+static void free_fragment_list(struct fragment *list)
+{
+       while (list) {
+               struct fragment *next = list->next;
+               if (list->free_patch)
+                       free((char *)list->patch);
+               free(list);
+               list = next;
+       }
+}
+
+static void free_patch(struct patch *patch)
+{
+       free_fragment_list(patch->fragments);
+       free(patch->def_name);
+       free(patch->old_name);
+       free(patch->new_name);
+       free(patch->result);
+       free(patch);
+}
+
+static void free_patch_list(struct patch *list)
+{
+       while (list) {
+               struct patch *next = list->next;
+               free_patch(list);
+               list = next;
+       }
+}
+
 /*
  * A line in a file, len-bytes long (includes the terminating LF,
  * except for an incomplete line at the end if the file ends with
@@ -204,6 +241,7 @@ struct line {
        unsigned hash : 24;
        unsigned flag : 8;
 #define LINE_COMMON     1
+#define LINE_PATCHED   2
 };
 
 /*
@@ -248,9 +286,6 @@ static int fuzzy_matchlines(const char *s1, size_t n1,
        const char *last2 = s2 + n2 - 1;
        int result = 0;
 
-       if (n1 < 0 || n2 < 0)
-               return 0;
-
        /* ignore line endings */
        while ((*last1 == '\r') || (*last1 == '\n'))
                last1--;
@@ -302,6 +337,11 @@ static void add_line_info(struct image *img, const char *bol, size_t len, unsign
        img->nr++;
 }
 
+/*
+ * "buf" has the file contents to be patched (read from various sources).
+ * attach it to "image" and add line-based index to it.
+ * "image" now owns the "buf".
+ */
 static void prepare_image(struct image *image, char *buf, size_t len,
                          int prepare_linetable)
 {
@@ -353,7 +393,6 @@ static void say_patch_name(FILE *output, const char *pre,
        fputs(post, output);
 }
 
-#define CHUNKSIZE (8192)
 #define SLOP (16)
 
 static void read_patch_file(struct strbuf *sb, int fd)
@@ -416,7 +455,7 @@ static char *squash_slash(char *name)
        return name;
 }
 
-static char *find_name_gnu(const char *line, char *def, int p_value)
+static char *find_name_gnu(const char *line, const char *def, int p_value)
 {
        struct strbuf name = STRBUF_INIT;
        char *cp;
@@ -439,11 +478,7 @@ static char *find_name_gnu(const char *line, char *def, int p_value)
                cp++;
        }
 
-       /* name can later be freed, so we need
-        * to memmove, not just return cp
-        */
        strbuf_remove(&name, 0, cp - name.buf);
-       free(def);
        if (root)
                strbuf_insert(&name, 0, root, root_len);
        return squash_slash(strbuf_detach(&name, NULL));
@@ -608,8 +643,13 @@ static size_t diff_timestamp_len(const char *line, size_t len)
        return line + len - end;
 }
 
-static char *find_name_common(const char *line, char *def, int p_value,
-                               const char *end, int terminate)
+static char *null_strdup(const char *s)
+{
+       return s ? xstrdup(s) : NULL;
+}
+
+static char *find_name_common(const char *line, const char *def,
+                             int p_value, const char *end, int terminate)
 {
        int len;
        const char *start = NULL;
@@ -630,10 +670,10 @@ static char *find_name_common(const char *line, char *def, int p_value,
                        start = line;
        }
        if (!start)
-               return squash_slash(def);
+               return squash_slash(null_strdup(def));
        len = line - start;
        if (!len)
-               return squash_slash(def);
+               return squash_slash(null_strdup(def));
 
        /*
         * Generally we prefer the shorter name, especially
@@ -644,8 +684,7 @@ static char *find_name_common(const char *line, char *def, int p_value,
        if (def) {
                int deflen = strlen(def);
                if (deflen < len && !strncmp(start, def, deflen))
-                       return squash_slash(def);
-               free(def);
+                       return squash_slash(xstrdup(def));
        }
 
        if (root) {
@@ -842,8 +881,10 @@ static void parse_traditional_patch(const char *first, const char *second, struc
                name = find_name_traditional(first, NULL, p_value);
                patch->old_name = name;
        } else {
-               name = find_name_traditional(first, NULL, p_value);
-               name = find_name_traditional(second, name, p_value);
+               char *first_name;
+               first_name = find_name_traditional(first, NULL, p_value);
+               name = find_name_traditional(second, first_name, p_value);
+               free(first_name);
                if (has_epoch_timestamp(first)) {
                        patch->is_new = 1;
                        patch->is_delete = 0;
@@ -853,7 +894,8 @@ static void parse_traditional_patch(const char *first, const char *second, struc
                        patch->is_delete = 1;
                        patch->old_name = name;
                } else {
-                       patch->old_name = patch->new_name = name;
+                       patch->old_name = name;
+                       patch->new_name = xstrdup(name);
                }
        }
        if (!name)
@@ -903,13 +945,19 @@ static char *gitdiff_verify_name(const char *line, int isnull, char *orig_name,
 
 static int gitdiff_oldname(const char *line, struct patch *patch)
 {
+       char *orig = patch->old_name;
        patch->old_name = gitdiff_verify_name(line, patch->is_new, patch->old_name, "old");
+       if (orig != patch->old_name)
+               free(orig);
        return 0;
 }
 
 static int gitdiff_newname(const char *line, struct patch *patch)
 {
+       char *orig = patch->new_name;
        patch->new_name = gitdiff_verify_name(line, patch->is_delete, patch->new_name, "new");
+       if (orig != patch->new_name)
+               free(orig);
        return 0;
 }
 
@@ -928,20 +976,23 @@ static int gitdiff_newmode(const char *line, struct patch *patch)
 static int gitdiff_delete(const char *line, struct patch *patch)
 {
        patch->is_delete = 1;
-       patch->old_name = patch->def_name;
+       free(patch->old_name);
+       patch->old_name = null_strdup(patch->def_name);
        return gitdiff_oldmode(line, patch);
 }
 
 static int gitdiff_newfile(const char *line, struct patch *patch)
 {
        patch->is_new = 1;
-       patch->new_name = patch->def_name;
+       free(patch->new_name);
+       patch->new_name = null_strdup(patch->def_name);
        return gitdiff_newmode(line, patch);
 }
 
 static int gitdiff_copysrc(const char *line, struct patch *patch)
 {
        patch->is_copy = 1;
+       free(patch->old_name);
        patch->old_name = find_name(line, NULL, p_value ? p_value - 1 : 0, 0);
        return 0;
 }
@@ -949,6 +1000,7 @@ static int gitdiff_copysrc(const char *line, struct patch *patch)
 static int gitdiff_copydst(const char *line, struct patch *patch)
 {
        patch->is_copy = 1;
+       free(patch->new_name);
        patch->new_name = find_name(line, NULL, p_value ? p_value - 1 : 0, 0);
        return 0;
 }
@@ -956,6 +1008,7 @@ static int gitdiff_copydst(const char *line, struct patch *patch)
 static int gitdiff_renamesrc(const char *line, struct patch *patch)
 {
        patch->is_rename = 1;
+       free(patch->old_name);
        patch->old_name = find_name(line, NULL, p_value ? p_value - 1 : 0, 0);
        return 0;
 }
@@ -963,6 +1016,7 @@ static int gitdiff_renamesrc(const char *line, struct patch *patch)
 static int gitdiff_renamedst(const char *line, struct patch *patch)
 {
        patch->is_rename = 1;
+       free(patch->new_name);
        patch->new_name = find_name(line, NULL, p_value ? p_value - 1 : 0, 0);
        return 0;
 }
@@ -1044,7 +1098,7 @@ static const char *stop_at_slash(const char *line, int llen)
  * creation or deletion of an empty file.  In any of these cases,
  * both sides are the same name under a/ and b/ respectively.
  */
-static char *git_header_name(char *line, int llen)
+static char *git_header_name(const char *line, int llen)
 {
        const char *name;
        const char *second = NULL;
@@ -1171,7 +1225,7 @@ static char *git_header_name(char *line, int llen)
 }
 
 /* Verify that we recognize the lines following a git header */
-static int parse_git_header(char *line, int len, unsigned int size, struct patch *patch)
+static int parse_git_header(const char *line, int len, unsigned int size, struct patch *patch)
 {
        unsigned long offset;
 
@@ -1287,7 +1341,7 @@ static int parse_range(const char *line, int len, int offset, const char *expect
        return offset + ex;
 }
 
-static void recount_diff(char *line, int size, struct fragment *fragment)
+static void recount_diff(const char *line, int size, struct fragment *fragment)
 {
        int oldlines = 0, newlines = 0, ret = 0;
 
@@ -1341,7 +1395,7 @@ static void recount_diff(char *line, int size, struct fragment *fragment)
  * Parse a unified diff fragment header of the
  * form "@@ -a,b +c,d @@"
  */
-static int parse_fragment_header(char *line, int len, struct fragment *fragment)
+static int parse_fragment_header(const char *line, int len, struct fragment *fragment)
 {
        int offset;
 
@@ -1355,7 +1409,7 @@ static int parse_fragment_header(char *line, int len, struct fragment *fragment)
        return offset;
 }
 
-static int find_header(char *line, unsigned long size, int *hdrsize, struct patch *patch)
+static int find_header(const char *line, unsigned long size, int *hdrsize, struct patch *patch)
 {
        unsigned long offset, len;
 
@@ -1403,8 +1457,12 @@ static int find_header(char *line, unsigned long size, int *hdrsize, struct patc
                                if (!patch->def_name)
                                        die("git diff header lacks filename information when removing "
                                            "%d leading pathname components (line %d)" , p_value, linenr);
-                               patch->old_name = patch->new_name = patch->def_name;
+                               patch->old_name = xstrdup(patch->def_name);
+                               patch->new_name = xstrdup(patch->def_name);
                        }
+                       if (!patch->is_delete && !patch->new_name)
+                               die("git diff header lacks filename information "
+                                   "(line %d)", linenr);
                        patch->is_toplevel_relative = 1;
                        *hdrsize = git_hdr_len;
                        return offset;
@@ -1463,7 +1521,7 @@ static void check_whitespace(const char *line, int len, unsigned ws_rule)
  * between a "---" that is part of a patch, and a "---" that starts
  * the next patch is to look at the line counts..
  */
-static int parse_fragment(char *line, unsigned long size,
+static int parse_fragment(const char *line, unsigned long size,
                          struct patch *patch, struct fragment *fragment)
 {
        int added, deleted;
@@ -1559,7 +1617,15 @@ static int parse_fragment(char *line, unsigned long size,
        return offset;
 }
 
-static int parse_single_patch(char *line, unsigned long size, struct patch *patch)
+/*
+ * We have seen "diff --git a/... b/..." header (or a traditional patch
+ * header).  Read hunks that belong to this patch into fragments and hang
+ * them to the given patch structure.
+ *
+ * The (fragment->patch, fragment->size) pair points into the memory given
+ * by the caller, not a copy, when we return.
+ */
+static int parse_single_patch(const char *line, unsigned long size, struct patch *patch)
 {
        unsigned long offset = 0;
        unsigned long oldlines = 0, newlines = 0, context = 0;
@@ -1632,7 +1698,7 @@ static inline int metadata_changes(struct patch *patch)
 static char *inflate_it(const void *data, unsigned long size,
                        unsigned long inflated_size)
 {
-       z_stream stream;
+       git_zstream stream;
        void *out;
        int st;
 
@@ -1652,6 +1718,11 @@ static char *inflate_it(const void *data, unsigned long size,
        return out;
 }
 
+/*
+ * Read a binary hunk and return a new fragment; fragment->patch
+ * points at an allocated memory that the caller must free, so
+ * it is marked as "->free_patch = 1".
+ */
 static struct fragment *parse_binary_hunk(char **buf_p,
                                          unsigned long *sz_p,
                                          int *status_p,
@@ -1739,6 +1810,7 @@ static struct fragment *parse_binary_hunk(char **buf_p,
 
        frag = xcalloc(1, sizeof(*frag));
        frag->patch = inflate_it(data, hunk_size, origlen);
+       frag->free_patch = 1;
        if (!frag->patch)
                goto corrupt;
        free(data);
@@ -1804,6 +1876,13 @@ static int parse_binary(char *buffer, unsigned long size, struct patch *patch)
        return used;
 }
 
+/*
+ * Read the patch text in "buffer" taht extends for "size" bytes; stop
+ * reading after seeing a single patch (i.e. changes to a single file).
+ * Create fragments (i.e. patch hunks) and hang them to the given patch.
+ * Return the number of bytes consumed, so that the caller can call us
+ * again for the next patch.
+ */
 static int parse_chunk(char *buffer, unsigned long size, struct patch *patch)
 {
        int hdrsize, patchsize;
@@ -2085,7 +2164,8 @@ static int match_fragment(struct image *img,
 
        /* Quick hash check */
        for (i = 0; i < preimage_limit; i++)
-               if (preimage->line[i].hash != img->line[try_lno + i].hash)
+               if ((img->line[try_lno + i].flag & LINE_PATCHED) ||
+                   (preimage->line[i].hash != img->line[try_lno + i].hash))
                        return 0;
 
        if (preimage_limit == preimage->nr) {
@@ -2363,6 +2443,11 @@ static void remove_last_line(struct image *img)
        img->len -= img->line[--img->nr].len;
 }
 
+/*
+ * The change from "preimage" and "postimage" has been found to
+ * apply at applied_pos (counts in line numbers) in "img".
+ * Update "img" to remove "preimage" and replace it with "postimage".
+ */
 static void update_image(struct image *img,
                         int applied_pos,
                         struct image *preimage,
@@ -2428,11 +2513,20 @@ static void update_image(struct image *img,
        memcpy(img->line + applied_pos,
               postimage->line,
               postimage->nr * sizeof(*img->line));
+       if (!allow_overlap)
+               for (i = 0; i < postimage->nr; i++)
+                       img->line[applied_pos + i].flag |= LINE_PATCHED;
        img->nr = nr;
 }
 
+/*
+ * Use the patch-hunk text in "frag" to prepare two images (preimage and
+ * postimage) for the hunk.  Find lines that match "preimage" in "img" and
+ * replace the part of "img" with "postimage" text.
+ */
 static int apply_one_fragment(struct image *img, struct fragment *frag,
-                             int inaccurate_eof, unsigned ws_rule)
+                             int inaccurate_eof, unsigned ws_rule,
+                             int nth_fragment)
 {
        int match_beginning, match_end;
        const char *patch = frag->patch;
@@ -2440,6 +2534,8 @@ static int apply_one_fragment(struct image *img, struct fragment *frag,
        char *old, *oldlines;
        struct strbuf newlines;
        int new_blank_lines_at_end = 0;
+       int found_new_blank_lines_at_end = 0;
+       int hunk_linenr = frag->linenr;
        unsigned long leading, trailing;
        int pos, applied_pos;
        struct image preimage;
@@ -2533,14 +2629,18 @@ static int apply_one_fragment(struct image *img, struct fragment *frag,
                                error("invalid start of line: '%c'", first);
                        return -1;
                }
-               if (added_blank_line)
+               if (added_blank_line) {
+                       if (!new_blank_lines_at_end)
+                               found_new_blank_lines_at_end = hunk_linenr;
                        new_blank_lines_at_end++;
+               }
                else if (is_blank_context)
                        ;
                else
                        new_blank_lines_at_end = 0;
                patch += len;
                size -= len;
+               hunk_linenr++;
        }
        if (inaccurate_eof &&
            old > oldlines && old[-1] == '\n' &&
@@ -2622,7 +2722,8 @@ static int apply_one_fragment(struct image *img, struct fragment *frag,
                    preimage.nr + applied_pos >= img->nr &&
                    (ws_rule & WS_BLANK_AT_EOF) &&
                    ws_error_action != nowarn_ws_error) {
-                       record_ws_error(WS_BLANK_AT_EOF, "+", 1, frag->linenr);
+                       record_ws_error(WS_BLANK_AT_EOF, "+", 1,
+                                       found_new_blank_lines_at_end);
                        if (ws_error_action == correct_ws_error) {
                                while (new_blank_lines_at_end--)
                                        remove_last_line(&postimage);
@@ -2638,6 +2739,15 @@ static int apply_one_fragment(struct image *img, struct fragment *frag,
                                apply = 0;
                }
 
+               if (apply_verbosely && applied_pos != pos) {
+                       int offset = applied_pos - pos;
+                       if (apply_in_reverse)
+                               offset = 0 - offset;
+                       fprintf(stderr,
+                               "Hunk #%d succeeded at %d (offset %d lines).\n",
+                               nth_fragment, applied_pos + 1, offset);
+               }
+
                /*
                 * Warn if it was necessary to reduce the number
                 * of context lines.
@@ -2704,6 +2814,12 @@ static int apply_binary_fragment(struct image *img, struct patch *patch)
        return -1;
 }
 
+/*
+ * Replace "img" with the result of applying the binary patch.
+ * The binary patch data itself in patch->fragment is still kept
+ * but the preimage prepared by the caller in "img" is freed here
+ * or in the helper function apply_binary_fragment() this calls.
+ */
 static int apply_binary(struct image *img, struct patch *patch)
 {
        const char *name = patch->old_name ? patch->old_name : patch->new_name;
@@ -2785,12 +2901,14 @@ static int apply_fragments(struct image *img, struct patch *patch)
        const char *name = patch->old_name ? patch->old_name : patch->new_name;
        unsigned ws_rule = patch->ws_rule;
        unsigned inaccurate_eof = patch->inaccurate_eof;
+       int nth = 0;
 
        if (patch->is_binary)
                return apply_binary(img, patch);
 
        while (frag) {
-               if (apply_one_fragment(img, frag, inaccurate_eof, ws_rule)) {
+               nth++;
+               if (apply_one_fragment(img, frag, inaccurate_eof, ws_rule, nth)) {
                        error("patch failed: %s:%ld", name, frag->oldpos);
                        if (!apply_with_reject)
                                return -1;
@@ -2909,7 +3027,7 @@ static int apply_data(struct patch *patch, struct stat *st, struct cache_entry *
                        return error("patch %s has been renamed/deleted",
                                patch->old_name);
                }
-               /* We have a patched copy in memory use that */
+               /* We have a patched copy in memory; use that. */
                strbuf_add(&buf, tpatch->result, tpatch->resultsize);
        } else if (cached) {
                if (read_file_or_gitlink(ce, &buf))
@@ -2922,7 +3040,10 @@ static int apply_data(struct patch *patch, struct stat *st, struct cache_entry *
                                /*
                                 * There is no way to apply subproject
                                 * patch without looking at the index.
+                                * NEEDSWORK: shouldn't this be flagged
+                                * as an error???
                                 */
+                               free_fragment_list(patch->fragments);
                                patch->fragments = NULL;
                        }
                } else {
@@ -3059,10 +3180,15 @@ static int check_preimage(struct patch *patch, struct cache_entry **ce, struct s
  is_new:
        patch->is_new = 1;
        patch->is_delete = 0;
+       free(patch->old_name);
        patch->old_name = NULL;
        return 0;
 }
 
+/*
+ * Check and apply the patch in-core; leave the result in patch->result
+ * for the caller to write it out to the final destination.
+ */
 static int check_patch(struct patch *patch)
 {
        struct stat st;
@@ -3216,7 +3342,7 @@ static void stat_patch_list(struct patch *patch)
                show_stats(patch);
        }
 
-       printf(" %d files changed, %d insertions(+), %d deletions(-)\n", files, adds, dels);
+       print_stat_summary(stdout, files, adds, dels);
 }
 
 static void numstat_patch_list(struct patch *patch)
@@ -3562,15 +3688,12 @@ static int write_out_one_reject(struct patch *patch)
        return -1;
 }
 
-static int write_out_results(struct patch *list, int skipped_patch)
+static int write_out_results(struct patch *list)
 {
        int phase;
        int errs = 0;
        struct patch *l;
 
-       if (!list && !skipped_patch)
-               return error("No changes");
-
        for (phase = 0; phase < 2; phase++) {
                l = list;
                while (l) {
@@ -3642,15 +3765,8 @@ static void prefix_patches(struct patch *p)
        if (!prefix || p->is_toplevel_relative)
                return;
        for ( ; p; p = p->next) {
-               if (p->new_name == p->old_name) {
-                       char *prefixed = p->new_name;
-                       prefix_one(&prefixed);
-                       p->new_name = p->old_name = prefixed;
-               }
-               else {
-                       prefix_one(&p->new_name);
-                       prefix_one(&p->old_name);
-               }
+               prefix_one(&p->new_name);
+               prefix_one(&p->old_name);
        }
 }
 
@@ -3660,12 +3776,10 @@ static void prefix_patches(struct patch *p)
 static int apply_patch(int fd, const char *filename, int options)
 {
        size_t offset;
-       struct strbuf buf = STRBUF_INIT;
+       struct strbuf buf = STRBUF_INIT; /* owns the patch text */
        struct patch *list = NULL, **listp = &list;
        int skipped_patch = 0;
 
-       /* FIXME - memory leak when using multiple patch files as inputs */
-       memset(&fn_table, 0, sizeof(struct string_list));
        patch_input_file = filename;
        read_patch_file(&buf, fd);
        offset = 0;
@@ -3689,13 +3803,15 @@ static int apply_patch(int fd, const char *filename, int options)
                        listp = &patch->next;
                }
                else {
-                       /* perhaps free it a bit better? */
-                       free(patch);
+                       free_patch(patch);
                        skipped_patch++;
                }
                offset += nr;
        }
 
+       if (!list && !skipped_patch)
+               die("unrecognized input");
+
        if (whitespace_error && (ws_error_action == die_on_ws_error))
                apply = 0;
 
@@ -3713,7 +3829,7 @@ static int apply_patch(int fd, const char *filename, int options)
            !apply_with_reject)
                exit(1);
 
-       if (apply && write_out_results(list, skipped_patch))
+       if (apply && write_out_results(list))
                exit(1);
 
        if (fake_ancestor)
@@ -3728,7 +3844,9 @@ static int apply_patch(int fd, const char *filename, int options)
        if (summary)
                summary_patch_list(list);
 
+       free_patch_list(list);
        strbuf_release(&buf);
+       string_list_clear(&fn_table, 0);
        return 0;
 }
 
@@ -3813,7 +3931,6 @@ int cmd_apply(int argc, const char **argv, const char *prefix_)
        int i;
        int errs = 0;
        int is_not_gitdir = !startup_info->have_repository;
-       int binary;
        int force_apply = 0;
 
        const char *whitespace_option = NULL;
@@ -3832,12 +3949,8 @@ int cmd_apply(int argc, const char **argv, const char *prefix_)
                        "ignore additions made by the patch"),
                OPT_BOOLEAN(0, "stat", &diffstat,
                        "instead of applying the patch, output diffstat for the input"),
-               { OPTION_BOOLEAN, 0, "allow-binary-replacement", &binary,
-                 NULL, "old option, now no-op",
-                 PARSE_OPT_HIDDEN | PARSE_OPT_NOARG },
-               { OPTION_BOOLEAN, 0, "binary", &binary,
-                 NULL, "old option, now no-op",
-                 PARSE_OPT_HIDDEN | PARSE_OPT_NOARG },
+               OPT_NOOP_NOARG(0, "allow-binary-replacement"),
+               OPT_NOOP_NOARG(0, "binary"),
                OPT_BOOLEAN(0, "numstat", &numstat,
                        "shows number of added and deleted lines in decimal notation"),
                OPT_BOOLEAN(0, "summary", &summary,
@@ -3872,7 +3985,9 @@ int cmd_apply(int argc, const char **argv, const char *prefix_)
                        "don't expect at least one line of context"),
                OPT_BOOLEAN(0, "reject", &apply_with_reject,
                        "leave the rejected hunks in corresponding *.rej files"),
-               OPT__VERBOSE(&apply_verbosely),
+               OPT_BOOLEAN(0, "allow-overlap", &allow_overlap,
+                       "allow overlapping hunks"),
+               OPT__VERBOSE(&apply_verbosely, "be verbose"),
                OPT_BIT(0, "inaccurate-eof", &options,
                        "tolerate incorrectly detected missing new-line at the end of file",
                        INACCURATE_EOF),