if (pos >= 0) {
                struct cache_entry *old = active_cache[pos];
                if (ce->ce_mode == old->ce_mode &&
+                   !ce_intent_to_add(old) &&
                    oideq(&ce->oid, &old->oid)) {
                        old->ce_flags |= CE_UPDATE;
                        discard_cache_entry(ce);
 
        test_cmp expect actual
 '
 
+test_expect_success 'checkout HEAD adds deleted intent-to-add file back to index' '
+       echo "nonempty" >nonempty &&
+       >empty &&
+       git add nonempty empty &&
+       git commit -m "create files to be deleted" &&
+       git rm --cached nonempty empty &&
+       git add -N nonempty empty &&
+       git checkout HEAD nonempty empty &&
+       git diff --cached --exit-code
+'
+
 test_done